Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms