Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a4Q5XF90 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a4Q5XF90 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms