Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Cxcl17Q5UW37 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Cxcl17Q5UW37 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl17Q5UW37 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Cxcl17Q5UW37 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl17Q5UW37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Cxcl17Q5UW37 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl17Q5UW37 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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Cxcl17Q5UW37 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl17Q5UW37 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxcl17Q5UW37 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Cxcl17Q5UW37 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Cxcl17Q5UW37 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Cxcl17Q5UW37 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Cxcl17Q5UW37 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl17Q5UW37 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Cxcl17Q5UW37 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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