Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mks1Q5SW45 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mks1Q5SW45 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms