Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bbs12Q5SUD9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bbs12Q5SUD9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bbs12Q5SUD9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bbs12Q5SUD9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bbs12Q5SUD9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bbs12Q5SUD9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bbs12Q5SUD9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bbs12Q5SUD9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bbs12Q5SUD9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms