Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psme4Q5SSW2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psme4Q5SSW2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psme4Q5SSW2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms