Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms