Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trdv2-2Q5R1A4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms