Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Trim41Q5NCC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Trim41Q5NCC3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Trim41Q5NCC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Trim41Q5NCC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Trim41Q5NCC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms