Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
1810065E05RikQ5NC41 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
1810065E05RikQ5NC41 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
1810065E05RikQ5NC41 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms