Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH6

Spdye4a, Speedy protein E4A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4aQ5IBH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spdye4aQ5IBH6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spdye4aQ5IBH6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spdye4aQ5IBH6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spdye4aQ5IBH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms