Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp28Q5I043 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp28Q5I043 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp28Q5I043 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp28Q5I043 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms