Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH67

Xkr4, XK-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr4Q5GH67 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xkr4Q5GH67 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xkr4Q5GH67 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Xkr4Q5GH67 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms