Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkaa1Q5EG47 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkaa1Q5EG47 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms