Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb3Q571F5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms