Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf608Q56A10 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Znf608Q56A10 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Znf608Q56A10 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Znf608Q56A10 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.1 ms