Protein–RNA interactions for Protein: Q45HK4

Sh2d1b2, SH2 domain-containing protein 1B2, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1b2Q45HK4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh2d1b2Q45HK4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sh2d1b2Q45HK4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh2d1b2Q45HK4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2d1b2Q45HK4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms