Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Garnl3Q3V0G7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Garnl3Q3V0G7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms