Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rcsd1Q3UZA1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rcsd1Q3UZA1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rcsd1Q3UZA1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rcsd1Q3UZA1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms