Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnpc3Q3UZ01 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnpc3Q3UZ01 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.6 ms