Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E330034G19RikQ3UWX6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms