Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn13Q3UW68 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn13Q3UW68 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn13Q3UW68 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms