Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd9Q3UQU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brd9Q3UQU0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brd9Q3UQU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brd9Q3UQU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms