Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc34Q3UI66 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc34Q3UI66 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.7 ms