Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lmod2Q3UHZ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Lmod2Q3UHZ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lmod2Q3UHZ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lmod2Q3UHZ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmod2Q3UHZ5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms