Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx6-3Q3UHX8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx6-3Q3UHX8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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