Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plxnd1Q3UH93 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plxnd1Q3UH93 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plxnd1Q3UH93 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms