Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Carmil3Q3UFQ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Carmil3Q3UFQ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Carmil3Q3UFQ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Carmil3Q3UFQ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms