Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wdr41Q3UDP0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr41Q3UDP0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms