Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VwceQ3U515 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VwceQ3U515 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VwceQ3U515 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.8 ms