Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam117bQ3U3E2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam117bQ3U3E2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam117bQ3U3E2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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