Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy4Q3TYX8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rufy4Q3TYX8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms