Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88bQ3TYP4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88bQ3TYP4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms