Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srsf6Q3TWW8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf6Q3TWW8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf6Q3TWW8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms