Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TTL0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q3TTL0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TTL0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TTL0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q3TTL0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TTL0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q3TTL0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3TTL0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTL0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTL0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3TTL0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms