Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
D17Wsu92eQ3TT38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
D17Wsu92eQ3TT38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
D17Wsu92eQ3TT38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
D17Wsu92eQ3TT38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms