Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2f1Q3THK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2f1Q3THK3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2f1Q3THK3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms