Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KncnQ307W7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KncnQ307W7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.3 ms