Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHK6

Gsdmc2, Gasdermin-C2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc2Q2KHK6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gsdmc2Q2KHK6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gsdmc2Q2KHK6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms