Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VgfQ0VGU4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VgfQ0VGU4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VgfQ0VGU4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VgfQ0VGU4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms