Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rundc1Q0VDN7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rundc1Q0VDN7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rundc1Q0VDN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rundc1Q0VDN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rundc1Q0VDN7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms