Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap5aQ0V8T9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5aQ0V8T9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5aQ0V8T9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms