Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnma1Q08460 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnma1Q08460 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnma1Q08460 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnma1Q08460 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms