Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf9Q07105 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf9Q07105 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdf9Q07105 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf9Q07105 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms