Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r236Q05A06 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r236Q05A06 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms