Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Sox12Q04890 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sox12Q04890 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sox12Q04890 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms