Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pfdn6Q03958 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pfdn6Q03958 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms