Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scg2Q03517 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scg2Q03517 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scg2Q03517 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms