Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Snai1Q02085 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snai1Q02085 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snai1Q02085 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms