Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4cP97470 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4cP97470 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4cP97470 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4cP97470 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4cP97470 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4cP97470 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4cP97470 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4cP97470 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4cP97470 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4cP97470 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms